年末調整において、団体保険の保険料控除に関するデータをCSVファイルで一括インポートすることはできますか？

はい、可能です。freee形式のCSVファイルを作成し、団体保険の控除情報をインポートする手順をご確認ください。

参考リンク

年末調整で団体保険の保険料控除情報をインポートする