役員の場合、勤怠管理は不要なことが多いですが、freee人事労務で「役員の勤怠登録」を行う設定にすることは可能ですか？

はい。役員であっても、勤怠基本設定で打刻を有効にしたり、勤務・賃金設定で出退勤時刻を設定することで、勤怠登録や管理を行うことが可能です。

参考リンク

役員を登録する（役員の情報を編集する）