役員がfreee人事労務で自ら出退勤の打刻を行いたい場合、システム上でどのような設定が必要ですか？

役員であっても、勤怠基本設定で「打刻機能を利用する」に設定し、役員向けの勤務・賃金設定を適用することで打刻が可能となります。

参考リンク

役員がfreeeで勤怠登録をしたい場合の設定方法は？